三門仔村碼頭位於大埔區，建於二十世紀七十年代。現有的碼頭，並沒有足夠位置停泊船隻，同時登岸梯級和步橋亦非常狹窄。
該碼頭位於船灣避風塘內，海面情況較穩定；而碼頭附近亦設有「鹽田仔魚類養殖區」。
該碼頭的海上交通較繁忙，根據現場觀察所見有超過百艘船隻經過碼頭附近地點。同時，由於三門仔村碼頭為遊客提供了前往地質公園的馬屎洲自然教育徑的途徑，前往該區的遊客人數不斷增加。
